Merck España ha recibido por parte de AENOR la certificación integral ISO 9001:2008 para sus diez sistemas de gestión. Esta certificación significa un paso más en el proyecto de certificación mátrix 9001 que Merck KGaA ha obtenido a nivel global. La adopción del modelo ISO permite orientar la compañía hacia la excelencia, la estandarización de procesos y su integración gradual en las distintas áreas de actividad con un objetivo común: aplicar la mejora continua en un entorno de innovación.

La filial española de la multinacional estadounidense Lilly ha recibido la calificación de empresa “Excelente” en la convocatoria 2009 del Programa Profarma (2009-2012), perteneciente al Ministerio de Industria, Turismo y Comercio. La compañía mantiene esta calificación desde 2002.